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自體免疫疾病就是自身免疫系統失調或高張，造成慢性發炎進而破壞組織。大家熟悉的疾病如:紅斑性狼瘡、僵直性脊椎炎、過敏性濕疹、腎病症候群、類風濕關節炎等。目前的治療不是類固醇就是免疫調節劑。大家都知道是免疫過高所以就是用藥把免疫系統給壓制，但為何免疫會過高呢？似乎沒有說法。於是就像天花板漏水了就僅僅擦地板，當然永遠擦不完。
由功能醫學的角度知道我們的腸道免疫系統佔我們全身免疫系統的70%，若有原因激發或破壞腸道免疫就會造成全身的免疫系統高張。這其中很重要的一個觀念是“腸漏”，也就是腸道壁的滲透力不正常過高。腸道壁黏膜有兩個很重要的功能就是“吸收”與“阻擋”。“吸收”就是把人身體需要養份從腸道吸入腸壁的血管、淋巴內。“阻擋”就是把未消化的蛋白質分子、毒素、細菌、黴菌等檔在腸腔內不讓其進入體內經由糞便排出。如果這“阻擋”的功能產生破裂也就是“腸漏”的現象，ㄧ但這些對身體不利的因子進入體內，體內的免疫系統發炎系統就會啟動，一但過度高張就是自體免疫疾病的病源。
現代醫學中對此類問題無法評估，對腸道的檢查即使做腸胃鏡也僅能觀察“結構”的改變，看是否有腫瘤、瘜肉或破皮，對上述的功能都無法評估，而功能醫學中的“小腸滲透力分析”是讓病人在睡前喝一杯糖水試劑（其中含乳果糖與甘露醇）然後收集一整晚的尿液再檢測尿液中此二種成份的比例。其中“乳果糖”是“阻擋”指標，而乳果糖與甘露醇的比例是“吸收”指標。在過去的3年中我們確實發現這腸漏的現象的確在自體免疫的病人身上經常發現，這些個案經由對腸道調整改善菌群、修補腸壁功能，確實都可見到明顯的效果, 包括臨床症狀改善及減少再發的機會。造成腸漏的原因包括慢性食物過敏、腸道菌群失調、消化不良、抗生素與消炎藥使用、年紀因素等。
在此我們先必需提一提有關母乳的哺育，新生嬰兒就必需要吃母親的奶去“成熟”腸胃功能,建立正確的免疫識別；認識誰是敵人誰是朋友，這是避免將來腸道功能混亂的第一步。可惜現代社會牛奶已成為主要的食物。我常問我的病人“牛奶是給誰喝的?”，當然是小牛囉！請問您的baby是小牛嗎?在過去幾年中由“慢性食物過敏”的檢測中知道牛奶、蛋及小麥是最常見的過敏原。想想這不是我們每天早上都經常吃的食物? 我想這跟現在小兒過敏比例高居不下有著密不可分的關係。甚至我們也見過小孩每天把牛奶當水喝卻呈現營養不良、免疫失調的現象。試想您每天讓他喝“毒”造成腸道壁吸收及阻擋功能破壞失調，小孩子會健康嗎?
因此，媽媽在懷孕前也把身體調健康至少確認沒有慢性食物過敏，在小孩出生後哺餵母乳一年，我想這是母乳能給孩子一輩子最珍貴的禮物了。~洪作行醫師
